昆明市儿童医院前身是1920年英国教会（中华圣公会）创办的教会医院——“惠滇医院”。1950年，由昆明市人民政府接管，作为昆明陆军医院的妇产分院，于1958年改建为昆明儿童专科医院。目前已成为云南省唯一一所集医疗、教学、科研、保健、预防为一体的儿童综合性医院。

医院现有正式职工527人，卫生技术人员479人，高级职称及硕士生导师以上专家75人，享受国家特殊津贴人员1名，市级有突出贡献优秀专业技术人员4人，市级学科带头人及后备人选5名，局级、院级学科带头人及后备人选26名，博士、硕士研究生42名。医院核定床位300张，实际开放床位400张。日诊治门、急诊患儿近3000人，年门诊人次70万人，年抢救转诊危、急、重症患儿万余人，抢救成功率98.1%。两年后新院建成，医院规模将达到1000张床，综合服务能力大大提高。成为一所面向全省，辐射周边和东南亚地区的现代化儿童医疗康复中心。

医院目前设有26个临床医技科室。有省级医学研究中心3个，市级医学重点学科5个和医学研究（技术）中心10个。设有picu、nicu、ccu，内、外科实行二级分科，小儿眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、儿保部、康复科、检验科、中心实验室、放射科、病理科等，各医技功能科室齐全。医疗设备先进，有双排螺旋ct、dr、cr、双c臂数字减影系统、全自动生化分析仪，多普勒彩色超声仪等100余台各种大中型医疗仪器设备。医院在省内率先完成了his系统和pacs系统的融合、建立了lis系统、医疗一卡通信息收费系统、医生工作站、排队呼叫系统等，为现代化、数字化医院奠定了坚实基础。保证了医疗、教学、科研、工作的开展。医院现已成为昆明医学院、大理学院、昆明市卫生学校、楚雄市卫生专科学校教学医院和儿科硕士点分部，并已开展了研究生的培养工作。每年有多项科研成果获省、市科技进步奖，有上百篇论文发表在国家级、省级专业期刊上。医院拥有一支老中青的儿科专业技术人才队伍。医院与国际组织机构有多项合作项目，得到国际有关组织的赞誉和省、市各级政府的嘉奖、表彰，获得省、市先进集体、市级文明单位等荣誉称号。

昆明市儿童医院承担着繁重的医疗、保健、科研和教学任务，为推动昆明地区及全省儿科医学的发展，挽救患儿的生命，促进儿童健康，提高人口素质，做出了十分重要的贡献。